Найди лекарство от рака

Широкую известность получил проект распределенных вычислений SETI@home, предназначенный для поиска признаков разумности в том море радиосигналов из космоса, которые принимают земные радиотелескопы. Любители Интернета во всем мире предоставили свои компьютеры для обработки сигналов, уловленных крупным радиотелескопом. Причем обработка сигналов идет, когда компьютер не загружен вашими задачами - а это до 80% времени его работы. В последнее время нашлось столько желающих подключить свой компьютер к программе поиска разумных сигналов, что им уже не хватает материала, добытого радиоастрономами.

Недавно о создании такой же системы, но более приближенной к земным нуждам, сообщили американский Национальный фонд исследований рака и компания Intel. Владельцам персональных компьютеров, подключенных к Интернету, предлагают участвовать в программе анализа сотен миллионов лекарств, перспективных в борьбе с раком.

Лейкемия (рак крови) является сейчас первой причиной детской смертности от болезней. В развитии этого заболевания основную роль играют четыре белковые молекулы, одна из которых специфична для лейкемии, а остальные три участвуют в развитии и других видов опухолей. Среди 250 миллионов перспективных целебных молекул надо найти такие, которые способны связаться с молекулами этих четырех белков, блокировав их функционирование. Причем, поскольку строение лекарственных молекул достаточно сложно, они могут принимать в организме разные конфигурации, и надо испытать каждый из этих вариантов на связываемость с раковыми белками. Общее необходимое время вычислений, если бы их делали на одном персональном компьютере, оценивают в 24 миллиона часов. Это будет крупнейшая программа биологических вычислений в истории.

Исследователи предлагают загрузить на ваш компьютер программу объемом в два мегабайта и «порцию» из ста молекул. В фоновом режиме, в моменты, когда используются не все вычислительные ресурсы вашей машины, программа будет так и сяк вертеть сложные молекулярные цепочки, пытаясь связать ими опасные белки. В среднем обработка одной молекулы займет 1-2 минуты, но попадаются особо сложные молекулы, с большим количеством вариантов конформации или возможных производных. Так что на обработку всей порции уйдет примерно 24 часа вычислений (это не означает, что ваш компьютер должен обязательно работать круглосуточно, можно его выключать, а при следующем включении расчеты возобновятся с места остановки). При очередном выходе в Интернет результаты обработки отправятся «заказчику», а в ответ будет получена следующая порция данных о молекулах.

Загрузить программу можно по адресу www.nfcr.org или www.intel.com/cure, причем требования к компьютеру вполне скромные. Фармакологи надеются, что с помощью Интернета продолжительность разработки новых лекарств от лейкемии сократится с 12 до 5 лет.